這項系統是由各醫療院所的實驗室，將檢驗結果進行「國際通用標準碼LOINC」（Logical Observation Identifier Names and Codes）對應後，透過「實驗室資料雲端交換平臺」傳送至疾管署，有別於以往必須經由醫師通報才能發現傳染病波動模式的作法，建立一套主動通報機制。
目前共有29家醫療院所藉由本項系統進行重要病原體的通報，疾管署並將該些檢驗資料再結合商業智慧軟體及地理資訊系統，建構自動化分析平臺，可自動產生相關時空分布圖表及預警趨勢。另外，透過大數據（big data）分析，瞭解並掌握病原體流行波動，協助研判疫情發展，並將次級統計圖表分享給參與醫院及其他公共衛生部門。
前瞻創新 防疫雲推展所面臨之考驗
開發「運用醫院電子病歷進行傳染病通報計畫」與「實驗室傳染病自動通報系統」二項計畫，在國內均無前例可循，一切從零開始。計畫開始前，歷經3年籌備，執行3項前瞻性研究，逐項確認可行性後，才開始推動。計畫執行時，由於參與單位包括衛生單位、醫院、資訊廠商、專業團體等等，各單位中又需結合資訊、檢驗、感控及行政等人員，專業領域及認知差異大，跨域合作困難，考驗溝通協調能力。
